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ソフィア線其實是ラナ線的分支，跟ラナ線除了感情戲的差異外，就是醫治ラナ方法的差異。
如果在ソフィア訴苦後答應ソフィア的告白，兩人就會當場H。之後男主想自己找工作，ソフィア表示自己錢多，於是男主就過起了小白臉的生活，每天跟ソフィア過著酒池肉林的生活。
但過了一段時間，ツクヨミ跟男主提到自從男主跟ソフィア第一次H的那一天，ラナ就主動尋找ツクヨミ照顧自己，想來應該是兩人的H被看到了，男主這才醒悟自己沒顧到ラナ。於是男主詢問ソフィア是否可以在ラナ的s-chip上加程式，輔助智力回復。
在男主把已經在警局的big-sys資料黑客到手後，ソフィア跟ツクヨミ兩人關在房間開始不眠不休撰寫程式，ソフィア還工作到昏倒3個小時，只因為想不出來要如何一口氣順利激活全大腦。
於是男主建議ソフィア出去走走，ソフィア便要求跟男主約會，一起到ソフィア喜歡的成田機場看飛機起降順便聊天。當男主提到在建立骨牌時為了不在中途失敗導致全倒，會分階段做的時候，ソフィア的靈感就來了--不用一次激活大腦所有區域，可以分階段做。回到家，ラナ突然要求跟男主H，男主戰戰兢兢的問ソフィア，結果變成了ソフィア看兩個人做。
雖然有了突破性的想法，但開發完成後缺了人體實驗，於是ソフィア突發奇想，打算讓自己跟夢山一樣酒精成癮，就有正當理由可以安裝醫療用AI，從而進行人體實驗。而且男主也一起。
雖然成功安裝AI並進行實驗，但實驗並不是一次成功，而是反覆測試了半年，問了ラナ的意願後，才真的安裝。安裝完成後，雖然ラナ發燒了一天，不過真的恢復正常了。
恢復正常後，要面對的就是男主跟ソフィア之間的關係。雖然ラナ說不記得智力下降時的事，但很明顯是說謊。覺得破壞男主跟ラナ關係的ソフィア，要ツクヨミ協助，打算回到英國，但在ラナ的推理下成功在機場攔截。
之後就是男主決定要不要三人行，如果不要，就是跟ソフィア度過，如果要，就是三人討論一起上大學。
