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在ラナ路線中ソフィア倒下時，如果男主決定為了償還過去的罪過捨棄一切的話，便會金盆洗手，除了幫助姊妹以外不用駭客技能，之後更是開始幫忙照顧ソフィア，正式切換到ソフィア線。extended版的ソフィア跟無印有一點不一樣的，是一開始就喜歡喝酒了。
ソフィア由於長期的過勞，出院後依然繼續了一段在家療養的時間，只會接公司的緊急工作。而男主平日上學，禮拜六會去幫忙做飯，於是培養了做飯的興趣。ソフィア從男主的言行誤會男主也喜歡自己，更糟糕的是自己還有點心動；發覺ソフィア有點怪的ラナ在ソフィア房門外偷聽，發現ソフィア真的對男主有意思。雖然忌妒，但想到姐姐對自己是盡心盡力，於是在某天要男主來自己家，要ソフィア跟男主出去逛逛。
一起出門後到了百貨公司，買日用品、去了霧香會去的cosplay服裝店看看想給ラナ穿的衣服、還一起去家庭餐廳喝酒，度過了快樂的一天。
兩個禮拜後，男主把ツクヨミ也一起帶過來幫忙打掃，也讓ソフィア喝酒。興頭正盛時，ソフィア的公司突然打電話要求某件工作明天早上要完成；正當ソフィア哀號要熬夜時，男主建議ツクヨミ幫忙。
那是跟AI相關的複雜運算，但ツクヨミ一瞬間就解出來了，讓ソフィア驚愕不已，只好向ソフィア坦承ツクヨミ是機器人。過不久，ソフィア也主動跟男主提起ツクヨミ的事，認為ツクヨミ就是「如果AI有心」這一終極命題的，理想的一個答案。
又過了一小段時間，ソフィア的身體也復原的差不多，於是跟大家宣告要回公司工作了。但離開家前，還特地跟ラナ說ラナ是最重要的，這麼強調反而讓在場大家都覺得反常。而ツクヨミ也說了，之前幫忙工作的資料，是的里雅斯特公司的資料，而且應該是夏洛特的。ラナ跟著兩人一起回男主家駭入BIG-SYS，只見ツクヨミ偽造了ソフィア的身分，就輕易讓男主存取到了許多相關資料，知道了夏洛特有竄改記憶功能，也就是說，ソフィア不但不是什麼外包公司，還知曉這個機能的事。
於是大家打算立刻阻止，動身前往醫院附屬研究所。同時，接受腦內晶片檢查的ソフィア，跟博士說了在這段休息的期間，遇到的一個學生跟高性能AI機器人，人沒有對AI做的所有決定言聽計從形成依賴現象，實現了人與AI和諧共處的理想，認為開發團隊是不是不相信過AI可能會自己產生心、愛，才會開發可以經由AI竄改記憶、甚至由AI對人類的所有舉止進行管理且強制執行這樣的玩意。
眼見ソフィア不聽自己的話，博士生氣的啟動了還在實驗中的進階洗腦功能。同時，男主一行已經到了博士所在地，察覺有人入侵的博士優雅的迎接入侵者，看到是ラナ領軍吃了一驚。但即使男主揭露了晶片有洗腦功能，卻因為不想在此時曝光證據所以博士也不為所動，還把被洗腦的ソフィア叫出來跟ラナ說明。
看到姐姐說出那些狂信者一樣的話讓ラナ十分難過，於是換成ツクヨミ來跟ソフィア以及博士嘴砲。ツクヨミ致命的一擊，是使用自己機器人的機能看穿博士自己沒裝晶片，明顯的就是怕會被AI否定自己的理想，也就是說博士早就知道自己理虧。而男主就趁大家都在嘴砲時，改了相關的code並降低博士的權限，使得晶片無洗腦能力且博士無法對其他有晶片的人動手腳，還順便把剛剛的影像都上傳到網路、揍了博士。相關人員都收押後，ソフィア也被送往醫院，之後自首。
一年後，收到許多民眾陳情的ソフィア再度回歸，歡迎ソフィア回家時，ラナ爆料ソフィア喜歡男主，並建議4個人一起生活。男主與ラナ畢業後，四人合開了偵探事務所，活用男主跟ソフィア的駭客技能。
