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現時進度是OP播放。故事的開頭，是男主被メデューサ士兵逮到，不過之後運用能力以及其他戰友的幫助脫離危機，但主要敵人ルビイ卻又出手。而這一切混亂的原因，要從五個月前男主的入學開始說起。
男主作為某組織特務，通過フリギア王立ジュエリー・アカデミア学園的考試，以第二名的成績於琥珀曆1617年9月1日入學。而任務說難也難，但要做的事卻也不多--要確保入學成績好到能被分到最上層的班級--ダイヤ班，之後在學期末的舞會就可以請親屬參觀，藉此偷竊組織最想要的祕寶--藏在這間學校的賢者之石。
但分班的結果，卻是被分到了今年突然新增的班級--ペガサス班。當然，同樣被分到這個班的其他學生--ベルカ・トリアーデ、メア・アシュリーペッカー、ヴェオ、マークス・フォン・レオンシュタイン也非常錯愕(アリアンナ好像還好)，要班導シャーロット給個解釋，卻只知道是老校長突然夢到天馬，還被託付要把這六個人編入這班級。除了成績，這學校還有一個入學條件，就是要有以自身的堅定意志結晶而成的寶石，可給予擁有者超能力。
男主當天晚上跟組織的報告，當然是戰戰兢兢，不過男主馬上提出方案--轉班可能。這學校有所謂的獎勵制度--エンブレム，可於學校活動表現優異時獲得，若集齊3個，就可以實現任何願望。
而這學期也正好有三次機會可以拿到エンブレム，第一次機會是過不久就要舉辦的圍繞全都市的障礙賽跑。雖然大家不太想合作，但大家都想轉班，所以拼了。
所有成員中，只有アリアンナ是樂天派，喜歡這個班級，也努力當和事佬。但第四王子マークス・フォン・レオンシュタイン看不起獸人ヴェオ(マークス的親戚被獸人部下咬死)；第一名入學，想繼續做研究的メア・アシュリーペッカー對於這個班不能用實驗器材很不滿；ベルカ・トリアーデ也不是很喜歡這個班。
雖然男主有去邀請，但除了男主、アリアンナ、メア以外，大家都不來練習，只知道自己的棒次。但大家都活用了自己的能力，順利拿到第一。首先，是ベルカ一開場就動用寶石力量，把5個人的接力棒砍斷讓他們失去資格；第二棒的ヴェオ的寶石能力是孤傲，很能跑；第三棒的王子沒用寶石，而是自己帶馬，結果還控制不住，讓賽況落後；第四棒是メア，寶石能力是分析，可以分析對方寶石能力，不過在比賽前利用電氣石自製小型飛艇；第五棒男主，因為被組織上司要求不能用寶石，只能用槍牽制；最後一棒アリアンナ，寶石能力可以變出天使翅膀，直接飛完自己要跑的地方--進OP。
